Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCF2Q9UG63 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCF2Q9UG63 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms