Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM10Q9UDY6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM10Q9UDY6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms