Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLKQ9UBT6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLKQ9UBT6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms