Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABI3Q9P2A4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABI3Q9P2A4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms