Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP5Q9NZZ3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP5Q9NZZ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms