Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMCD1Q9NZU5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMCD1Q9NZU5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms