Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDE1Q9NZC3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms