Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms