Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PODXL2Q9NZ53 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXL2Q9NZ53 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PODXL2Q9NZ53 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms