Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CWC25Q9NXE8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CWC25Q9NXE8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms