Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TDP1Q9NUW8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TDP1Q9NUW8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDP1Q9NUW8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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