Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG3Q9NT62 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG3Q9NT62 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG3Q9NT62 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG3Q9NT62 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG3Q9NT62 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG3Q9NT62 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG3Q9NT62 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG3Q9NT62 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG3Q9NT62 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG3Q9NT62 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms