Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms