Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT82Q9NSB4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms