Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GKN1Q9NS71 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GKN1Q9NS71 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GKN1Q9NS71 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms