Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 CDV3-209ENST00000515421 1305 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -12e-6■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF9-203ENST00000548326 1704 nt8.53□□□□□ -1.042e-6■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RAN-203ENST00000448750 2455 ntTSL 27.24□□□□□ -1.252e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.262e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 SEC61G-206ENST00000461536 437 ntTSL 24.61□□□□□ -1.672e-6■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 SET-202ENST00000372686 1029 ntTSL 23.13□□□□□ -1.912e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.022e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-12■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.912e-12■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 BTF3-209ENST00000514505 740 ntTSL 56.42□□□□□ -1.382e-12■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 BTF3-208ENST00000514360 1177 ntTSL 26.36□□□□□ -1.392e-12■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 BTF3-205ENST00000509708 515 ntTSL 53.14□□□□□ -1.912e-12■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.684e-14■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.414e-14■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL31-201ENST00000264258 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.714e-14■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.064e-14■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.64e-14■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL31-210ENST00000441435 717 ntTSL 24.87□□□□□ -1.634e-14■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.644e-14■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL31-209ENST00000419276 781 ntTSL 54.16□□□□□ -1.744e-14■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.754e-14■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 CALM2-207ENST00000484408 682 ntTSL 522.1■■□□□ 1.132e-7■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPS24-208ENST00000475468 623 ntTSL 521.35■■□□□ 1.012e-20■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.272e-20■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPS24-207ENST00000466129 661 ntTSL 29.68□□□□□ -0.862e-20■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPS24-205ENST00000464716 452 ntTSL 24.81□□□□□ -1.642e-20■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPS24-210ENST00000478655 727 ntTSL 1 (best)3.31□□□□□ -1.882e-20■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPS21-203ENST00000370592 401 ntTSL 213.28□□□□□ -0.282e-10■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.483e-12■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.133e-12■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 CSNK2B-206ENST00000468255 1792 ntTSL 514.5□□□□□ -0.093e-12■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 AL662899.3-202ENST00000617558 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.413e-12■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 CSNK2B-204ENST00000375885 1061 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.463e-12■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 AL662899.3-201ENST00000375880 2487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.613e-12■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.993e-12■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 PFN1-202ENST00000572383 539 ntTSL 319.52■□□□□ 0.721e-9■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.061e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 310.41□□□□□ -0.741e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 510.41□□□□□ -0.741e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 29.59□□□□□ -0.871e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 29.54□□□□□ -0.881e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -11e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 38.8□□□□□ -11e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 28.8□□□□□ -11e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 37.84□□□□□ -1.151e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 56.08□□□□□ -1.441e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 24.83□□□□□ -1.641e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.731e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 23.64□□□□□ -1.831e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -21e-19■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.094e-13■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.24e-13■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.34e-13■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-205ENST00000542344 1675 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.494e-13■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-210ENST00000547773 1967 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.514e-13■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.834e-13■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.854e-13■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.374e-13■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.474e-13■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-225ENST00000552147 1009 ntTSL 53.68□□□□□ -1.824e-13■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 NAP1L1-224ENST00000552056 1981 ntTSL 52.89□□□□□ -1.954e-13■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-213ENST00000590406 756 ntTSL 321.36■■□□□ 1.014e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-208ENST00000589252 662 ntTSL 521.36■■□□□ 1.014e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.894e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.744e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.714e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.654e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.654e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.524e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-213ENST00000556465 220 ntTSL 317.34■□□□□ 0.374e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.334e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.314e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-210ENST00000589869 910 ntTSL 316.4■□□□□ 0.224e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-217ENST00000591981 565 ntTSL 416.02■□□□□ 0.164e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-206ENST00000461594 375 ntTSL 315.19■□□□□ 0.024e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-214ENST00000590448 604 ntTSL 213.91□□□□□ -0.184e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-218ENST00000592364 576 ntTSL 513.54□□□□□ -0.244e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MTHFD2-202ENST00000409601 1865 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.324e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-205ENST00000432849 411 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.584e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-219ENST00000592989 553 ntTSL 511.4□□□□□ -0.584e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-204ENST00000397505 333 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.614e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-212ENST00000590324 807 ntTSL 510.87□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.684e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-209ENST00000589611 995 ntTSL 210.32□□□□□ -0.764e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MTHFD2-203ENST00000409804 1757 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.884e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-214ENST00000556654 362 ntTSL 37.96□□□□□ -1.144e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-203ENST00000585650 520 ntTSL 57.21□□□□□ -1.264e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL52-209ENST00000553965 327 ntTSL 24.06□□□□□ -1.764e-8■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.626e-86■□□□□ 9.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPS29-208ENST00000557519 333 ntTSL 310.66□□□□□ -0.72e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS29-204ENST00000554075 826 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.952e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS29-205ENST00000556230 624 ntTSL 1 (best)8.46□□□□□ -1.062e-9■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.356e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.026e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-224ENST00000581718 574 ntTSL 220.87■□□□□ 0.936e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.936e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-203ENST00000472367 794 ntTSL 319.56■□□□□ 0.726e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-212ENST00000483588 688 ntTSL 318.8■□□□□ 0.66e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-229ENST00000584177 574 ntTSL 418.35■□□□□ 0.536e-8■□□□□ 9.3
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.086e-8■□□□□ 9.3
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