Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL28Q9NRJ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL28Q9NRJ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms