Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST12Q9NRB3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHST12Q9NRB3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms