Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4ENIF1Q9NRA8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EIF4ENIF1Q9NRA8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4ENIF1Q9NRA8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms