Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR8Q9NR97 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms