Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIT2Q9NQR4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms