Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCUBE2Q9NQ36 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms