Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPCPD1Q9NPB8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPCPD1Q9NPB8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPCPD1Q9NPB8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPCPD1Q9NPB8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms