Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLMQ9NP87 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLMQ9NP87 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms