Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB6Q9NP58 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB6Q9NP58 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCB6Q9NP58 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCB6Q9NP58 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCB6Q9NP58 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCB6Q9NP58 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCB6Q9NP58 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms