Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA4Q9HCM2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA4Q9HCM2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms