Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3GQ9HC16 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOBEC3GQ9HC16 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms