Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CLSPNQ9HAW4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLSPNQ9HAW4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms