Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UPF2Q9HAU5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms