Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A3Q9HAS3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A3Q9HAS3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms