Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC52A2Q9HAB3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms