Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRKRIP1Q9H875 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKRIP1Q9H875 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms