Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A3Q9H7F0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A3Q9H7F0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A3Q9H7F0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms