Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms