Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NXF3Q9H4D5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms