Protein–RNA interactions for Protein: Q9H322

VCX2, Variable charge X-linked protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX2Q9H322 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCX2Q9H322 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms