Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S9

IKZF4, Zinc finger protein Eos, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF4Q9H2S9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IKZF4Q9H2S9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IKZF4Q9H2S9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IKZF4Q9H2S9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IKZF4Q9H2S9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IKZF4Q9H2S9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IKZF4Q9H2S9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IKZF4Q9H2S9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKZF4Q9H2S9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF4Q9H2S9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms