Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1X1

RSPH9, Radial spoke head protein 9 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH9Q9H1X1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSPH9Q9H1X1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSPH9Q9H1X1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSPH9Q9H1X1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSPH9Q9H1X1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSPH9Q9H1X1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSPH9Q9H1X1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSPH9Q9H1X1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSPH9Q9H1X1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSPH9Q9H1X1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RSPH9Q9H1X1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSPH9Q9H1X1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPH9Q9H1X1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RSPH9Q9H1X1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms