Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0M0

WWP1, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP1, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP1Q9H0M0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WWP1Q9H0M0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms