Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1EQ9GZS1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1EQ9GZS1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms