Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE41Q9C0J9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms