Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMBRA1Q9C0C7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AMBRA1Q9C0C7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms