Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXQ1Q9C009 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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