Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRNKL1Q9BZJ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRNKL1Q9BZJ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms