Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM55Q9BYV6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms