Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX4Q9BYU1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms