Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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KRTAP9-3Q9BYQ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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