Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RNF17Q9BXT8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms