Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TDRD1Q9BXT4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TDRD1Q9BXT4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms