Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRIP1Q9BX63 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRIP1Q9BX63 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRIP1Q9BX63 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms